交点計算は、計算処理によっては、自動で結線し直しされます。

計算上の交点は、mm以下の端数がありますが、地籍システムでは、mm以下の端数を保持することができませんので、丸め処理を行います。
厳密には線上に落ちませんので、交点計算により結線し直しされる場合は、この線分を構成線としている地番は、面積値の変動が発生します。

座標値入力においても、同様です。
何らかの計算により得られた線上の点座標を入力し、その点の場所を大きく拡大しても、線上にはありません。
こちらは、元の筆界線を削除し、結線のしなおしが必要になります。